Бирюков Владислав Владимирович | НОЦ «Центр геномных исследований» СФУ

Участник проекта геномных исследований

Образование:

2012-2016 Институт фундаментальной биологии и биотехнологии Сибирского федерального университета, кафедра биофизики

Тема дипломной работы: "De novo сборка транскриптома лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) и анализ его статистических и комбинаторных свойств"

Диплом бакалавра с отличием

2016-2018 Институт фундаментальной биологии и биотехнологии Сибирского федерального университета, магистерская программа "Геномика и биоинформатика"

Онлайн-курсы:

Bioinformatics: Life Sciences on Your Computer by Johns Hopkins University (Coursera);
Введение в биоинформатику (Introduction to Bioinformatics) от Санкт-Петербургского государственного университета (Coursera);
The Data Scientist’s Toolbox by Johns Hopkins University (Coursera);
Programming for Everybody (Python) by University of Michigan (Coursera);
Анализ данных в R от Института биоинформатики (Stepik.org);
Introduction to Bioconductor: Annotation and Analysis of Genomes and Genomic Assays (edX);
Statistics and R (edX)

Опыт работы:

С июня 2014 г. по настоящее время – исполнитель НИР по проекту «Геномные исследования основных бореальных лесообразующих хвойных видов и их наиболее опасных патогенов в Российской Федерации»

C января 2018 г. – инженер-исследователь Лаборатории лесной геномики Сибирского федерального университета

Конференции, школы:

The First International Conference on Symmetry, Barcelona, Spain;
Выездной семинар по системной биологии, г. Санкт-Петербург;
Третья летняя школа по биоинформатике, г. Москва;
Международная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых «Проспект Свободный-2015»
Седьмая Международная Школа молодых ученых «Системная биология и биоинформатика», г. Новосибирск;
53-я Международная научная студенческая конференция, г. Новосибирск;

Публикации:

Michael Sadovsky, Yulia Putintseva, Vladislav Birukov, Serafima Novikova, and Konstantin Krutovsky De Novo Assembly and Cluster Analysis of Siberian Larch Transcriptome and Genome // Lecture Notes in Computer Science. – 2016. – 9656. – Pp. 455-464.
М.Г. Садовский, В.В. Бирюков, Ю.А. Путинцева,Н.В. Орешкова, Е.А. Ваганов, К.В. Крутовский Симметрия транскриптома сибирской лиственницы //Journal of Siberian Federal University. Biology. – 2015. – 8(3). – С. 278-286.

Тезисы:

Vladislav V. Biriukov, Michael G. Sadovsky, Yuliya A. Putintseva, Natalia V. Oreshkova, Konstantin V. Krutovsky Symmetry in the Transcriptome and Genome Sequences of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.). // Proceedings. – 2018. – 2(1), 56
Бирюков В. В., Новикова С. В., Путинцева Ю. А., Садовский М. Г., Крутовский К. В. СИММЕТРИЯ В СТАТИСТИЧЕСКИХ СТРУКТУРАХ ТРАНСКРИПТОМА И ГЕНОМА ХВОЙНЫХ ВИДОВ // НЕЙРОИНФОРМАТИКА, ЕЁ ПРИЛОЖЕНИЯ И АНАЛИЗ ДАННЫХ. – 2017
Орешкова, Н. В., Ю. А. Путинцева, Д. А. Кузмин, В. В. Шаров, В. В. Бирюков, К. О. Дейч, A. A. Ибе, E. A. Шилкина, К. В. Крутовский Секвенирование и сборка геномов лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) и сосны сибирской кедровой (Pinus sibirica Du Tour) и предварительные данные анализа транскриптома// Материалы 4-го международного совещания “Сохранение лесных генетических ресурсов Сибири”. – 2015 г. – С. 127-128;
Krutovsky K.V., Oreshkova N.V., Putintseva Yu.A., Kuzmin D.A., Pavlov I.N., Sharov V.V., Biryukov V.V., Makolov S.V., Deych K.O., Bondar E.I., Ushakova O.A., Ibe A.A., Shilkina E.A., Sadovsky M.G., Vaganov E.A. Pinus sibirica and Larix sibirica whole genome de novo sequencing // The ProCoGen Final Open International Conference and Workshops on Promoting Conifer Genomic Resources. – 2015. – O-07;
Oreshkova N.V., Putintseva Yu.A., Kuzmin D.A., Sharov V.V., Biryukov V.V., Makolov S.V., Deych K.O., Ibe A.A., Shilkina E.A., Krutovsky K.V. THE WHOLE DE NOVO GENOME SEQUENCING AND ASSEMBLY OF SIBERIAN LARCH (LARIX SIBIRICA LEDEB.) AND SIBERIAN PINE (PINUS SIBIRICA DU TOUR.) // Материалы 3-й международной конференции “Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений”. – 2015. – С. 37;
Krutovsky K.V., Oreshkova N.V., Putintseva Yu.A., Kuzmin D.A., Sharov V.V., Biryukov V.V., Makolov S.V., Deych K.O., Bondar E.I., Ushakova O.A., Ibe A.A., Shilkina E.A. DE NOVO SEQUENCING OF CONIFER MEGAGENOMES // Материалы 3-й международной конференции “Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений”. – 2015. – С. 28;
В.В. Бирюков De novo сборка транскриптома лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) // Сборник тезисов третьей летней школы по биоинформатике. – 2015. – С. 8;
Бирюков В.В. De novo сборка транскриптома лиственницы сибирской // Сборник материалов Международной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Проспект Свободный-2015». – 2015. – С. 4-5;
V.V. Biryukov De novo transcriptome assembly of the Siberian larch // Abstracts of the 7th International Young Scientists School “Systems Biology and Bioinformatics”. – 2015. – С. 11;
В.В. Бирюков De novo сборка транскриптома лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) // Материалы 53-й Международной научной студенческой конференции. – 2015. – С. 177;

Научные интересы:

Биоинформатика, молекулярная биология, биохимия, иммунология