Genome Research and Education Center of SibFU

Владислав Бирюков

 

 

Бирюков Владислав Владимирович

Участник проекта геномных исследований

E-mail:vladbir2010@gmail.com

Образование:

2012-2016 Институт фундаментальной биологии и биотехнологии Сибирского федерального университета, кафедра биофизики

Онлайн-курсы

1. Bioinformatics: Life Sciences on Your Computer by Johns Hopkins University (Coursera)

2. Введение в биоинформатику (Introduction to Bioinformatics) от Санкт-Петербургского государственного университета (Coursera)

3. The Data Scientist’s Toolbox by Johns Hopkins University (Coursera)

4. Programming for Everybody (Python) by University of Michigan (Coursera)

5. Анализ данных в R от Института биоинформатики (Stepik.org) 

Опыт работы:

С июня 2014 г. по настоящее время – исполнитель НИР по проекту «Геномные исследования основных бореальных лесообразующих хвойных видов и их наиболее опасных патогенов в Российской Федерации».

Конференции, школы:

1. 53-я Международная научная студенческая конференция, г. Новосибирск;

2. Седьмая Международная Школа молодых ученых «Системная биология и биоинформатика», г. Новосибирск;

3. Международная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых «Проспект Свободный-2015»;

4. Третья летняя школа по биоинформатике, г. Москва.

5. Выездной семинар по системной биологии, г. Санкт-Петербург

Тезисы и публикации

1. В.В. Бирюков De novo сборка транскриптома лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) // Материалы 53-й Международной научной студенческой конференции. – 2015. – С. 177;

2. V.V. Biryukov De novo transcriptome assembly of the Siberian larch // Abstracts of the 7th International Young Scientists School “Systems Biology and Bioinformatics”. – 2015. – С. 11;

3. Бирюков В.В. De novo сборка транскриптома лиственницы сибирской // Сборник материалов Международной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Проспект Свободный-2015». – 2015. – С. 4-5;

4. В.В. Бирюков De novo сборка транскриптома лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) // Сборник тезисов третьей летней школы по биоинформатике. – 2015. – С. 8;

5. Krutovsky K.V., Oreshkova N.V., Putintseva Yu.A., Kuzmin D.A., Sharov V.V., Biryukov V.V., Makolov S.V., Deych K.O., Bondar E.I., Ushakova O.A., Ibe A.A., Shilkina E.A. DE NOVO SEQUENCING OF CONIFER MEGAGENOMES // Материалы 3-й международной конференции “Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений”. – 2015. – С. 28;

6. Oreshkova N.V., Putintseva Yu.A., Kuzmin D.A., Sharov V.V., Biryukov V.V., Makolov S.V., Deych K.O., Ibe A.A., Shilkina E.A., Krutovsky K.V. THE WHOLE DE NOVO GENOME SEQUENCING AND ASSEMBLY OF SIBERIAN LARCH (LARIX SIBIRICA LEDEB.) AND SIBERIAN PINE (PINUS SIBIRICA DU TOUR.) // Материалы 3-й международной конференции “Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений”. – 2015. – С. 37;

7. Krutovsky K.V., Oreshkova N.V., Putintseva Yu.A., Kuzmin D.A., Pavlov I.N., Sharov V.V., Biryukov V.V., Makolov S.V., Deych K.O., Bondar E.I., Ushakova O.A., Ibe A.A., Shilkina E.A., Sadovsky M.G., Vaganov E.A. Pinus sibirica and Larix sibirica whole genome de novo sequencing // The ProCoGen Final Open International Conference and Workshops on Promoting Conifer Genomic Resources. – 2015. – O-07;

8. Орешкова, Н. В., Ю. А. Путинцева, Д. А. Кузмин, В. В. Шаров, В. В. Бирюков, К. О. Дейч, A. A. Ибе, E. A. Шилкина, К. В. Крутовский Секвенирование и сборка геномов лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) и сосны сибирской кедровой (Pinus sibirica Du Tour) и предварительные данные анализа транскриптома// Материалы 4-го международного совещания “Сохранение лесных генетических ресурсов Сибири”. – 2015 г. –С. 127-128;

9. М.Г. Садовский, В.В. Бирюков, Ю.А. Путинцева,Н.В. Орешкова, Е.А. Ваганов, К.В. Крутовский Симметрия транскриптома сибирской лиственницы //Journal of Siberian Federal University. Biology. – 2015.–8(3). – С. 278-286.

10. Michael Sadovsky, Yulia Putintseva, Vladislav Birukov, Serafima Novikova, and Konstantin Krutovsky De Novo Assembly and Cluster Analysis of Siberian Larch Transcriptome and Genome // Lecture Notes in Computer Science. – 9656. – Pp. 455-464.

Научные интересы:

Биоинформатика, молекулярная биология, биохимия, иммунология