Система для генерации кластеров cBot в автоматическом режиме производит создание молекулярных кластеров ДНК методом мостиковой ПЦР, используя проточную ячейку, поверхность которой предварительно модифицирована иммобилизованными олигонуклеотидами.
Система для генерации кластеров cBot предназначена для создания молекулярных кластеров ДНК в проточной ячейке при проведении секвенирования с использованием высокопроизводительных секвенаторов Illumina: HiSeq 2500/1500, HiSeq 2000/1000.
На первом этапе проводится гибридизация комплементарных участков выбранных образцов ДНК с иммобилизованными олигонуклеотидами, удлинение последних с помощью ДНК-полимеразы, денатурация исходных образцов ДНК. Затем проводится гибридизация полученных ДНК-цепей на олигонуклеотиды, иммобилизованные на положке (образуются мостиковые структуры), синтез комплементарных цепей с помощью ДНК-полимеразы.
Завершающая стадия денатурации приводит к образованию готового продукта – матрицы, содержащей необходимые одноцепочечные молекулы ДНК, иммобилизованные на поверхности проточной ячейки и готовые для секвенирования. Для обеспечения описанной процедуры система cBot в автоматическом режиме осуществляет точное дозирование реагентов для генерации кластеров и образцов ДНК в проточную ячейку, на поверхности которой формируются кластеры ДНК.
Программное обеспечение встроенного управляющего компьютера обеспечивает контроль качества и процесса создания кластеров ДНК для последующего секвенирования в высокопроизводительном режиме.
