Genome Research and Education Center of SibFU

Евгения Бондар

 

Бондар Евгения Ивановна

Участник проекта геномных исследований

E-mail:bone-post@ya.ru

Тел.: 8-913-524-9300

Образование:

2012-2016 гг. Сибирский федеральный университет, Институт фундаментальной биологии и биотехнологии,  Кафедра биофизики.

Специализация: «биология», бакалавр.

Тема выпускной бакалаврской работы: «Сборка, аннотирование и анализ статистических и комбинаторных свойств хлоропластного генома лиственницы сибирской».

Тема магистерской работы: «Разработка микросателлитных маркеров лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) на основе полногеномного de novo секвенирования».

Дополнительное образование:

Bioinformatics: Life Sciences on Your Computer by Johns Hopkins University. Онлайн курс на сайте coursera.org.

Введение в биоинформатику, Санкт Петербургского Государственного Университета. Онлайн курс на сайте coursera.org.

Programming for Everybody (Getting Started with Pythonby University of Michigan. Онлайн курс на сайте coursera.org.

Introduction to Genomic Technologiesby Johns Hopkins University. Онлайн курс на сайте coursera.org.

Анализ данных в RОнлайн курс от Института биоинформатики на stepik.org.

Опыт работы:

С июня 2014 г. по настоящее время – исполнитель ВТК по проекту «Геномные исследования основных бореальных лесообразующих хвойных видов и их наиболее опасных патогенов в Российской Федерации».

Участие в конференциях:

1-е место на Международной научной конференции «Молодёжь и наука: проспект Свободный», секция биофизика; тема доклада «Сборка и аннотирование хлоропластного генома лиственницы сибирской и поиск маркеров (SNPs)», Красноярск, 2015.

2-е место на 53-ей Международной научной студенческой конференции МНСК-2015, секция биоинформатика; тема доклада «Сборка и аннотирование хлоропластного генома лиственницы сибирской», Новосибирск, 2015.

Выступление с докладом на международной школе молодых ученых “System biology and Bioinformatics”,  Новосибирск, 2015.

Участие в Летней школе по биоинформатике, Москва, 2015.

Участие в молодежном научном форуме «Гибридные технологии и биомедицинские приложения», Калининград, 2015.

Стендовый доклад на международном научном форуме молодых ученых «Наука будущего – наука молодых», Севастополь, 2015.

Стендовый доклад на конференции «Биоинформатика регуляции и структуры генома\системная биология», Новосибирск, 2016.

Участие с докладом в 55-ой Международной научной студенческой конференции МНСК, Новосибирск, 2017.

Публикаци и тезисы:

Sadovsky M. G.; Bondar E. I.; Putintseva Yu. A.; Oreshkova N. V.; Vaganov E. A.; Krutovsky K. V. Seven-Cluster Structure of Larch Chloroplast Genome // Journal of Siberian Federal University. 2015. Vol. 8(3). P. 268-277.

Bondar E.I., Ushakova O.A., Putintseva Yu.A., Oreshkova N.V., Krutovsky K.V. Assembly and annotation of Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) chloroplast genome and the search for polymorphic genetic markers (SSRs and SNPs) // Материалы 3-й международной конференции “Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений”. – 2015. – С.8;

Бондар Е.И., Путинцева Ю.А., Орешкова Н.В., Крутовский К.В. Изучение хлоропластного генома лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) и разработка полиморфных хлоропластных маркеров // Материалы 4-го международного совещания “Сохранение лесных генетических ресурсов Сибири”. – 2015 г. – С. 20-21;

Бондар Е.И. Сборка и аннотирование хлоропластных геномов сибирских видов хвойных // Сборник тезисов участников форума «Наука будущего – наука молодых» – 2015. – Т. 2, С. 17-19.

Krutovsky K.V., Oreshkova N.V., Putintseva Yu.A., Kuzmin D.A., Sharov V.V., BiryukovV.V., Makolov S.V., Deych K.O., BondarE.I., Ushakova O.A., Ibe A.A., Shilkina E.A. DE NOVO SEQUENCING OF CONIFER MEGAGENOMES// Материалы 3-й международной конференции “Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений”. – 2015. – С. 28;

Krutovsky K.V., Oreshkova N.V., Putintseva Yu.A., Kuzmin D.A., Pavlov I.N., Sharov V.V., Biryukov V.V., Makolov S.V., Deych K.O., Bondar E.I., Ushakova O.A., Ibe A.A., Shilkina E.A., Sadovsky M.G., Vaganov E.A. Pinus sibirica and Larix sibirica whole genome de novo sequencing // The ProCoGen Final Open International Conference and Workshops on Promoting Conifer Genomic Resources. – 2015. – O-07.

E.I. Bondar. Assembly and annotation of Siberian larch chloroplast genome and the search for single nucleotide polymorphisms // Abstracts of the 7th International Young Scientists School “Systems Biology and Bioinformatics”. – 2015. – P. 13.

Бондар Е.И..Сборка и аннотирование хлоропластного генома лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) и поиск маркеров (SNPs) // Сборник материалов Международной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Проспект Свободный-2015». – 2015. – С. 6-7.

Е.И. Бондар. Сборка и аннотирование хлоропластного генома лиственницы  сибирской // Материалы 53-й Международной научной студенческой конференции. – 2015. – С. 178.

Е.И. Бондар. Сборка и сравнительный анализ хлоропластных геномов хвойных рода Larix// Сборник тезисов третьей летней школы по биоинформатике. – 2015. – С. 9.

Bondar E.I., Putintseva, Y.A., Krutovsky K.V.. Siberian larch chloroplast genome analysis over triplet frequency distribution // Abstracts of the tenth international conference on bioinformatics of genome regulation and structure\systems biology. — 2016. — P. 48.

Bondar E.I., Sadovsky M.G., Putintseva Y.A., Senashova M. Yu. Comparative studying of multicluster structure of chloroplast genomes // Abstracts of the eighth International Young Scientists School “Systems Biology and Bioinformatics”. — 2016. — P. 12.

Е.И. Бондар. Поиск семикластерной структуры в хлоропластном геноме лиственницы сибирской // Материалы 53-й Международной научной студенческой конференции. Биология. – 2016. – С. 152.

Sadovsky M.G., Putintseva Y.A., Bondar E.I., Krutovsky K.V. L. sibirica Ledeb. chloroplast genome yields unusual seven-cluster structure // International work-conference on Bioinformatics and biomedical engineering IWBBIO 2016. Proceedings Extended abstracts. Granada (Spain). — 2016. — P. 360.